Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl39Q9JKF7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms