Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smco4Q9JIS3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smco4Q9JIS3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smco4Q9JIS3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smco4Q9JIS3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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