Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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