Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp29Q9ES63 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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