Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim54Q9ERP3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms