Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms