Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms