Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms