Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Subh2bvQ9D9Z7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Subh2bvQ9D9Z7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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