Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pdzd9Q9D9M4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms