Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms