Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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