Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms