Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc94Q9D6J3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms