Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms