Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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