Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc6bQ9D289 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms