Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Bcas2Q9D287 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bcas2Q9D287 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bcas2Q9D287 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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