Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1lQ9D1E5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms