Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs4Q9CXZ1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs4Q9CXZ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ndufs4Q9CXZ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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