Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl11Q9CXW4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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