Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Exo5Q9CXP9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Exo5Q9CXP9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Exo5Q9CXP9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Exo5Q9CXP9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms