Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkrip1Q9CWV6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms