Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms