Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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