Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms