Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Ykt6Q9CQW1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ykt6Q9CQW1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms