Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms