Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms