Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms