Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms