Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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