Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NenfQ9CQ45 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NenfQ9CQ45 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms