Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Bhlhe41Q99PV5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms