Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tlr3Q99MB1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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