Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nus1Q99LJ8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms