Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms