Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms