Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms