Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin3bQ91ZU9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms