Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek8Q91ZR4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms