Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Prpf6Q91YR7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms