Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms