Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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