Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh10Q8VCH7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms