Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms