Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otud6bQ8K2H2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otud6bQ8K2H2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms