Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c1Q8K284 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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