Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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