Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms